소화계(消化系)는 소화(消化)를 담당하는 기관계이다. 소화란, 동물이 섭취한 음식에서 영양분을 흡수하기 위해 신체 내부의 물리적, 화학적 작용을 통하여 음식물을 잘게 섞거나 혼합하는 과정을 말한다. 입, 식도, 위, 십이지장, 간, 쓸개, 이자, 소장, 대장, 항문이 모두 소화계에 속하는 기관들이다. 이외에 치아를 소화기관에 추가하기도 한다.

소화계가 완전히 음식물을 소화하는 데에는 보통 1-2시간이 걸린다. 이는 음식물의 종류와 양, 그리고 소화기관의 능력에 따라 조금씩 다른데, 소화 흡수가 빠른 밥이나 죽, 감자, 설탕, 과일, 우유[1] 등의 경우 식후 1시간이면 소화가 완료되며, 밀가루와 고기, 콩 등 잡곡 종류는 2시간 이상이 걸린다. 가장 소화하기 힘든 음식은 기름에 튀긴 밀가루 음식으로 치킨, 튀김, 인스턴트 라면의 경우 몸 속에서 4,5시간까지 들어있는 경우도 있다.[2] 늦은 밤에 기름진 음식을 먹고 자면 다음 날 속이 뒤집히는 이유가 뱃속에 먹은 튀김들이 뎅뎅 불어 그대로 들어있기 때문이다.

소화기는 작동할 때에 신체의 에너지를 음식물에 따라 50%~80%까지 끌어다 쓴다.

수술 시 환자에게 금식을 시키는 이유는 마취 시 소화기능이 정지해서 위 속에 있는 음식물이 썩거나 급체할 위험을 방지하기 위함이다.