2001년 3월 29일에 신설되었다. 당시에는 화정지구와 능곡역을 경유하였다.

2008년 11월 27일에 3200번에게 화정지구 구간을 넘겨주고 백석동에서 바로 인천국제공항으로 가도록 변경되었다.

2018년 1월 15일부터 인천국제공항 제2여객터미널로 연장되었고 2대가 증차되었다.

2019년 11월 21일부터 23일까지 명성운수의 파업으로 인해 대원고속에서 차량 7대를 차출하여 임시로 운행하였다.

2020년 4월 3일부터 코로나19 사태로 인한 이용수요 급감으로 인해 배차간격이 늘어난다. 시간표를 따로 참고하여 이용해야한다.

수도권 통합 요금이 적용되지 않는 한정면허 버스이다. 그럼에도 직행좌석버스 면허로 운행하는 이유는 경기도에서 공항버스를 운행하는 다른 업체들과 달리 명성운수는 시외버스 면허가 없어 시내버스 면허로 인가를 받은 것이다. 그러므로 버스 도색은 잘못되지 않았다. 이는 3200번, 9000번도 마찬가지로 교통카드 이용 내역을 조회하면 3200번, 9000번과 같이 공항버스로 표기된다.

요금은 현금 9000원, 카드 8500원으로 청소년 할인은 없다. 어린이 할인은 현금과 카드 공통으로 5000원.

짐이 없거나 작다면 '대화역~일산동구청' 구간에서 33-1번을 타고 사우역으로 가서 308번으로 환승하면 3300번보다 저렴하게 갈 수 있으나 시간이 더 오래걸린다.

막차가 끊기면 인천국제공항철도를 타고 디지털미디어시티역에서 하차한 후 771번을 타거나 월드컵경기장 북측에 정차하는 9711A번을 탑승한 후 행신동에서 내려서 707번, 1000번, 2000번, 9714번으로 환승하면 된다. 목적지가 일산동부경찰서 이전이나 중산동, 탄현동의 경우 월드컵경기장 북측으로 나와서 9711A번을 타면 된다. 3300번의 막차가 끊길 즈음 디지털미디어시티역 6번 출구를 막으므로 8번 출구로 나와서 2번 출구로 가야 한다.

2017년까지 유니버스 스페이스 엘레강스 전중문형 가스 차량으로만 운행하여 짐칸이 없다 보니 승객과 기사의 실랑이가 간혹 일어나기도 하였다. 명성운수에서 차량 내부에 캐리어를 올려놓을 수 있도록 앞좌석 일부를 철거하여 캐리어를 올려놓을 수 있도록 배려하였다. 그럼에도 시청에 공항버스가 짐칸이 없다는 민원이 쏟아지자 증차분으로 전문형 디젤 차량 2대가 투입되었고, 2018년에 전중문형 가스 차량이 모두 전문형 디젤 차량으로 교체되면서 짐칸 문제가 해결되었다. 짐칸은 일산동구와 일산서구로 나누어 운영한다.

짐칸 문제, 교통카드 단말기가 다르기 때문에 3300번 차량들은 다른 노선으로 차출되지 않으며 전용 예비차도 준비된 상태이다.

교통 정체가 심하면 수도권제1순환고속도로를 경유하지 않고 행신동으로 넘어와서 권율대로로 진입한 후 인천국제공항까지 인천국제공항고속도로만 이용한다.

수도권 광역버스 입석금지가 실시된 후 명성운수 직행좌석버스 차량들에 잔여좌석 표시기가 부착된 반면 3300번은 표시기가 없다.

시내 구간 이용을 요구하면 기사들이 바로 승차를 거부하거나 환승이 안 된다고 돌려말한다. 시내 구간 승객으로 공항으로 가는 승객들의 자리가 줄어들면 안 되기 때문이다. 1000번이 일산에서 3300번과 완벽하게 동일하다.

명성운수에서 가장 수익이 많은 노선이다. 일산신도시와 인천국제공항을 잇는 수요가 압도적으로 많고 환승할인도 적용되지 않으므로 요금을 온전히 징수할 수 있다. 3300번의 수익으로 72번, 77번, 82번, 108번, 870번, 871번등의 적자를 메운다는 풍문이 돌기도 한다.

2017년에 기존 EB 단말기를 제거하고 캐시비 시외버스 단말기를 설치하였다. 단말기가 교체되면서 인천국제공항에서 출발하기 전에 시외버스 안전방송이 송출된다.

직행좌석버스임에도 중앙차로 내 모든 정류장에 정차한다. 좌석버스들이 거의 지나치는 백병원, 호수마을까지 모두 정차하지만 화정동과 행신동을 경유하지 않고 바로 고속도로로 진입하기 때문에 소요시간이 그렇게 길지는 않다.

명성운수에서 운행하는 노선 중에서 가장 서쪽과 남쪽을 운행하는 노선이다.

배차간격 변경으로 인해 35~95분 간격으로 운행한다.

업체 측의 별도 안내공지가 나오기 전까지는 해당 시간표로 운행한다.임시 시간표

파일:Seoulmetro3_icon.svg 수도권 전철 3호선 : 대화역, 주엽역, 정발산역, 마두역, 백석역

파일:AREX_icon.svg 인천국제공항철도 : 인천공항1터미널역, 인천공항2터미널역

파일:인천국제공항공사 로고.svg 인천공항 자기부상철도 : 인천공항1터미널역, 합동청사역