2002년 3월 경기대후문-상현지구-수지1.2지구-동천지구-머내-판교-경부고속도로-양재역-강남역-논현역-신사역-한남동-중앙극장-서울역 노선으로 개통했다.

번호에서 보면 알 수 있듯 5500번의 지선이지만, 자잘한 노선 변경을 거쳐 현재에 이르렀다. 과거에는 5500번의 강남대로 경유, 심야노선 역할을 했다. 5500번이 폐선된 현재는 M4101과 더불어 수지구 주민들의 서울 강북구 교통을 책임지는 양대 노선이 되었는데, 수지구 내에서 담당하는 수요가 다소 다르다.[4]

2008년 7월 내곡고속화도로 대신 경부고속도로를 이용하게 되었다.

2011년 10월 수지구 직행좌석버스 개편에 따라 신봉동 이마트 사거리에서 신봉1로를 거쳐 용인서울고속도로를 경유하고 강남대로 구간을 지나지 않는 지금의 노선이 되었다.[6] 이로 인해 한때 심야에 강남대로에서 수지구민의 발이 되던 심야노선이 5500번이 대신 하게 되었으나, 5500번의 폐선으로 더 이상 강북지역에서 수지구까지 운행하는 심야노선은 없다.

2014년 8월 14일부터 서울역방향 진행시 서울백병원, 평화방송 중앙차로 정류장에서 남대문세무서 가변차로로 이전하여 정차한다.

2017년 12월 31일부터 종로 중앙버스전용차로 개통으로 인해 남대문세무서 → 종로2가 → 조계사 구간을 서울백병원 → 을지로2가 → 우리은행종로지점 → 조계사 구간으로 변경하면서 서울역 방향 진행 시 남대문세무서 가변이 아닌, 서울백병원 중앙차로 정류장으로 환원되었다.

2018년 11월 5일부터 수지구 방면에 한하여 경로가 금토JC 경유로 변경되면서, 백현교차로와 낙생고등학교에는 정차하지 않는다. 관련 게시물

2019년 1월 1일에 1550번 출신 차량 1대가 증차되었다. 1550번에 2층버스가 투입되면서 과잉공급이 되버린 관계로 한대 감차되었는데, 반사이익으로 배차간격도 개선할 겸 이 노선에 한대 증차된 것이다.

2019년 1월 7일부터 서울 방면도 금토JC를 경유하면서 백현교차로와 낙생고등학교에 정차하지 않는다.

2019년 7월 29일부터 1550번에서 운행하던 2층버스가 전부 5500-2번으로 재배치되었다. 따라서 2층버스 최초로 남산 1호터널을 경유하는 노선이 되었다.

2019년 12월 16일부터 1500-2번 출신 차량 1대가 증차되었다.

2020년 7월 9일부터 서울역버스환승센터 5번 승강장 공사로 인해 6번 승강장에 정차한다.

2020년 9월 6일에 서울역버스환승센터 5번 승강장 공사가 마무리 되면서 5번 승강장으로 다시 환원되었다.

2012년 전까지만 해도 디젤차량 위주였지만, 광교영업소에 가스충전소가 설치되면서 가스차량도 소수 투입되기 시작했다. 이후 2015년에는 FX II 116 전문형 디젤 신차가 대량으로 출고되어 투입되었으나 신분당선 연장개통에 따른 광교영업소 노선 감차로 현재는 타 영업소로 줄줄히 흩어지는 과정에서 전 차량 가스차로 운행하게 되었다. 2019년에는 구형 로얄럭셔리 차량을 폐차하는 과정에서 8201번 디젤 차량을 보내면서 하모니 신차를 받아왔는데, 8201번에 구형 차량을 보내고 이 노선에 신차를 투입했다. 하지만 최근에는 에버랜드 영업소에 가스충전소 운영을 이유로 동일연식의 디젤차량과 맞바꾸었다가 2층버스를 투입하면서 디젤차들을 다른 노선으로 이동시켜 제외하고 전 차량 천연가스버스로 다니고 있다가 2020년에는 하모니 디젤 신차와 시외부 출신 2015년식 FX2 차량 일부가 들어왔다.

2017년 10월 부로 5500번이 폐선되면서 수지에서 한남동으로 바로 갈 수 있는 유일한 직행좌석버스이며 5500번 계열에서 지금까지 살아남은 유일한 노선이다.

2019년 1월부로 금토JC를 통해 수지구 서부 지역과 한남동 사이를 고속도로로 직통하기 때문에 이전보다 속도가 훨씬 빨라졌는데[10], 평일 오전시간대에는 서수지IC에서 한남동까지 25분만에 주파할 정도다[다만]. 동시에 1550번 출신 차량이 한대 증차되어 배차간격도 개선된 것은 물론 M4101번에서 수요가 상당수[12] 넘어왔다. 다른 5500번 시리즈 노선이 폐선되어 사라진 와중에 유일하게 살아남은 이 노선은 오히려 최전성기를 맞았다.

한때 같은 루트를 지나 강남으로 향하는 1550번에, 수요가 더 많은 본 노선보다 먼저 2층 버스가 투입되어 사람들이 의문을 가졌었다. 다만 이는 남산1호터널 요금소의 제한높이가 충분히 높지 않아서였으며, 2019년 7월 현재 남산1호터널 요금소의 높이가 높아져 2층 버스를 투입할 수 있게 됨에 따라 현재는 1550번에 투입된 2층 버스가 옮겨온 상태이다. 단, 2층 버스는 공휴일을 제외한 주중에만 운행된다. 여담으로, 2층 버스 운행 노선 최초로 서울 강북 도심에 진입한 기념비적인 노선이기도 하다.

신봉고등학교, 성복고등학교 학생들도 어느정도 이용하는 노선이다. 신봉동 일대에서는 돌아서 가는 마을버스에 비하면 이 노선이나 1550번이 시간상 더 이득. 요금은 신경 안쓴다

2012년식 FX II 116 2079호 차량에는 휴대폰 충전기가 설치되어있으나 고장나서 충전이 안된다.

용인서울고속도로를 경유하는 유일한 서울 도심행 직행좌석버스다.

현재는 기점부 스티킹이 광교(호수공원)에서 수지,광교로 바뀌었다.(2층버스 제외)

2019년 12월 30일에 고속도로에서 M4101번과 사고가 났다. 관련 기사

원 출처는 경기교통DB이며, 노선별 이용인원의 자료를 재구성했다.

경기도 자료는 연간데이터가 존재하지 않아 매년 3월을 기준으로 작성했다.

파일:Seoulmetro1_icon.svg 수도권 전철 1호선: 종각역, 서울역

파일:Seoulmetro2_icon.svg 서울 지하철 2호선: 을지로입구역

파일:Seoulmetro4_icon.svg 수도권 전철 4호선: 서울역

파일:Seoulmetro5_icon.svg 수도권 전철 5호선: 광화문역

파일:GJLine_icon.svg 수도권 전철 경의·중앙선: 서울역

파일:SinbundangLine_icon.svg 신분당선: 상현역, 성복역

파일:AREX_icon.svg 인천국제공항철도: 서울역

일반 철도역: 서울역(KTX, ITX-새마을, 무궁화, 누리로)