이 대회부터 SKE48, NMB48, HKT48에서 '연구생 예선'이 실시된다. 지점 연구생들을 대상으로 토너먼트를 실시하여 이를 통과한 사람은 정규 멤버 예선에 진출하고, 정규 멤버 예선까지 통과해야 비로소 본선에 진출한다. 따라서 지점 연구생들은 본선에 진출하려면 예선을 두 번 치루어야 하기 때문에 본선에 진출하기 더욱 어려워졌다.

또한 겸임 제도가 실시되면서 지점 멤버 중 AKB48 겸임 멤버들은 본점 멤버 자격으로 본선에 자동 진출하게 된다. 이로 인해 당시 AKB48 팀K 겸임 마츠이 쥬리나와 AKB48 팀B 겸임 와타나베 미유키는 예선을 치르지 않고 본선으로 직행하게 되었다.

본선에 진출했던 에토 사야카가 사퇴를 선언하면서 가위바위보 대회 개최 이틀 전인 2012년 9월 16일 HKT48 극장에서 패자부활전이 개최되었다. 연구생 예선에서는 3자 대결을 통해 후카가와 마이코가 패자부활전에 진출하였고, 이후 토너먼트를 거친 결과 시모노 유키가 본선에 진출하게 되었다.