해상자위대 자위함대[1] 소속의 함대급 부대이다. 함대사령으로 해장(중장)이 보임되며, 막료장은 해장보(소장)다. 대한민국 해군의 잠수함사령부에 해당한다.

함대 내에 한국의 전단에 상당하는 대군(隊群)이 있다. 제1잠수대군(第1潜水隊群)과 제2잠수대군(第2潜水隊群)이 있고 그 외에 전대급 부대인 잠수함교육훈련대(潜水艦教育訓練隊), 제1연습잠수대(第1練習潜水隊) 등이 있다.

잠수함 승조원들은 출항 중 수상함보다는 훨씬 열악한 환경에서 생활해야 한다. 잠수함이 출항하고 입항할 때까지 가족과 연락은 불가하고, 개인실은 함장만이 쓸 수 있으며[2], 나머지는 계급에 따라 3단 침대나 2단 침대를 써야 한다. 샤워는 3일에 1회 가능하다.근데 이것도 일본 잠수함들이 모두 한국보다 톤수가 훨 크니 가능한 것이다 .한국 잠수함 승조원들은 이보다 더 열악한 생활을 하고 있다.

물론 입항해 있는 동안은 영외 거주자는 자신의 개인 숙소 및 자택에서, 영내 거주자는 육상 생활관에서 보낸다.