SCP-003은 키틴질의 머리카락이나 손톱 따위로 구성된 마더보드의 형상을 한 SCP-003-1과 003-1이 설치되어 있는 석판인 SCP-003-2로 이루어져 있다.

두 개의 구성 요소인 003-1과 003-2는 별도의 기원을 두고 있는 것으로 보인다.
둘 다 CPU를 꽂을 수 없다. 그렇다면 이건 그냥 기판 아닌가?[5]

003-1은 그 이상한 재료와는 별개로 굉장히 고도의 회로를 가지고 있다. 또한 주변의 상황을 지각할 수 있는 것으로 판단되나 평소에는 공격성 등을 보이지 않는다.

현대의 언어학적 지식으로 알 수 없는 룬이 새겨져 있는 석판으로, 내부 컴퓨터에 의해 제어되고 있는 것으로 추정되나 그 컴퓨터의 정보에 접근하는 것은 불가능하다. 내부 동력원이 존재하나 이미 동력을 상실하였고, 그럼에도 불구하고 열이나 빛, 방사선 등을 방출하는 능력을 가지고 있다. 특히 빛은 특정한 패턴을 가지고 방출되고 있다. 또한 003-1과는 다르게 주위를 지각하는 능력을 가지고 있지는 않은 것으로 보인다.

온도가 35°C 이하로 떨어졌을 때 003은 변칙성을 보이며, 이 변칙성이 개체가 안전 SCP가 아닌 유클리드 SCP로 지정된 가장 큰 이유이다. 우선 언제나 공통적으로 나타나는 첫 번째 단계에서 003-1은 질량을 크게 불린 뒤 거미불가사리와 같은 형상을 취한다. 그 불가사리의 팔들은 주변 환경을 지각하기 위한 것으로 보이며, 그 과정에서 주변의 물질들이 예측할 수 없는 괴상한 물질들로 변화하기도 한다. 다만 003-1에 붙어있는 003-2는 이런 변화의 영향을 받지 않는다.

이후의 두 번째 변화는 003-1에 어떤 유기물질이 닿았냐에 따라서 다른 양상을 보인다. 003-1은 접촉한 유기물질에 대해서 분석하고, 이 과정에서 질량의 증가율이 20~90%까지 둔화된다. 이때, 복잡한 유기물질[6]이 접촉했을수록 둔화율이 커지는 것을 통해 003-1이 유기물질을 분석하는 데에 자체적인 처리 능력을 상당수 사용한다는 것을 추론할 수 있다. 유기물질에 접촉한 이후에는 주변의 무기물들까지도 물리적 조성을 엉망으로 만들거나 무기물 안의 유기 요소들을 변화시킨다.

위의 문단에서 알 수 있듯, 변칙성을 줄이기 위해서 온도는 반드시 35°C보다 높게 유지되어야 한다. 이상적인 온도는 100°C 이상이며, 지나치게 복잡한 유기체[7]는 003-1에 접촉해서는 안된다. 이로 인해 만약 정전이 발생하여 온도 유지에 실패했을 경우, 인간이 접촉하기 위해서는 Category IV보다 복잡한 유기체가 체내에 존재하지 않도록[8] 완벽한 멸균 과정을 거쳐야 한다. 인간이 접촉해야 하는 이유는 그들의 체온을 통해 003-1의 온도를 35°C 위로 올리기 위해서이다.

이러한 일련의 과정에서 003-2의 룬 활동(빛의 패턴이나 색깔 변화)은 사후 보고되어야 하며, 만약 이런 룬 활동이 갑자기 중단되었을 경우 그 즉시 보고해야 한다.