모험을 시작할 때 전국도감과 자전거[2]를 주고 시작한다.

마박사에게서 도감을 받은 뒤 연구소에서 나갈 때 포켓트레를 획득한다.

광휘/빛나가 포켓몬 포획 튜토리얼을 진행하는 대신 배틀을 신청하고, 배틀 후 몬스터볼 30개를 준다.

포켓몬들의 종족값, 타입, 특성, 자력기, 기술폭 등이 일부 변경되어 상향 평준화되었다. 대체로 7세대 본가와 동일하나, 대우가 안 좋은 포켓몬들은 여러 방면으로 대거 상향을 받아서 모든 포켓몬이 스토리에서 충분히 활약할 수 있다고 봐도 무방하다.[10] 숨특 외 특성이 하나밖에 없던 포켓몬 중 대부분이 숨겨진 특성이 2번째 특성으로 등장하고 메가진화 시의 특성이 도입된 경우도 있으며, 해당 포켓몬과 어울리지 않거나 5세대 이후에 추가된 특성들은 다른 특성으로 대체되었다.[11] 별도로 세이크리드 골드 & 스톰 실버에서 도입되었던 타입, 특성이 그대로 도입된 것도 있지만 가장 큰 변화는 페어리 타입의 적용.[12] 그리고 기존의 일부 기술을 삭제하고 5세대 이후에 만들어진 기술들이 도입되었다. 기존 기술들 또한 위력, 명중률, PP가 포켓몬스터 울트라썬·울트라문 기준으로 조정되었고, 일부 기술들만 본 게임 한정으로 추가적으로 조정되었다.

포켓몬들의 진화 과정이 변경되었다. 세이크리드 골드와 마찬가지로 핫삼, 강철톤, 에레키블, 폴리곤Z 등 아이템을 쥐고 교환해야 진화하는 포켓몬들의 아이템을 사용 아이템으로 바꿔 사용하면 바로 진화시킬 수 있다. 단순 교환으로 진화하는 후딘, 괴력몬, 딱구리, 팬텀은 세이크리드 골드와는 달리 특정 레벨에 진화하며, 리피아, 글레이시아, 블래키, 에브이, 빈티나는 특정 아이템을 사용해야 진화할 수 있다. 또한 꼬몽울, 랑딸랑, 리오르는 친밀도가 높을 때 시간에 상관없이 레벨업을 하면 진화할 수 있다.

트레이너들의 포켓몬이 싹 갈아엎어졌다. 특정 타입을 사용하는 체육관 관장이나 사천왕은 타입이 바뀌지는 않지만 첫 배틀부터 무조건 6마리로 승부를 건다. 레벨[22]과 기술배치 역시 급강화되어서 유채부터 난이도가 급상승한다. 또한 빛나/광휘는 물론 지나가던 충호, 팔파크에서는 코크런 & 카틀레야와도 배틀할 수 있다. 또한 태홍은 깨어진세계의 최종 배틀 전에 디아루가와 펄기아를 꺼낸다! 그리고 승부장소에서는 원작과는 달리 모든 체육관 관장과 파트너 NPC, 빛나/광휘와 용식이 앉아 있으며, 하루에 한 번씩이 아니라 무제한으로 배틀이 가능하다.

아이템과 기술머신 위치가 싹 갈아엎어졌다. 기술머신은 한 번 얻을 때마다 99개씩 받게 되며, 마트에서 사거나, 팔거나 버리는 것도 불가능하다. 기술머신을 리필하고 싶으면 포켓몬 리그의 NPC에게 말을 걸면 된다.

경험치/노력치 트레이너가 추가되었다. 신수마을의 키우미집 오른쪽에 있는 NPC가 트레이너로 처음 대화 시 모든 파워 시리즈 아이템을 지급해주고, 다시 말을 걸어 경험치 또는 특정 노력치를 선택한 뒤 배틀하기를 반복하는 것으로 빠르게 경험치와 노력치를 올릴 수 있다. 예를 들어 경험치를 선택했다면 본인이 선택한 레벨대(25~85)의 럭키 6마리와의 배틀이 진행되는 식이다.[24]

게임 내 이벤트가 추가, 변경되었다. 전체 스토리는 기존의 플래티넘과 동일하지만 이벤트들이 추가되면서 진행 순서에도 소소하게 변경이 이루어졌다.

그 외의 잡다한 수정사항들

이브이: 광휘/빛나로부터 집에 한번 다녀오라는 말을 듣고 엄마에게 말을 걸면 부엌에 있는 몬스터볼 안 5레벨의 이브이를 가져갈 수 있다. 그리고 무쇠탄갱의 강석에게서 원하는 진화의돌을 받을 수 있다.[44]

나머지 4세대 스타팅: 잔모래마을의 연구소에서 마박사의 오른쪽 방에 있는 가방을 선택한 후 마박사와의 대화를 마치면 가방에서 모부기, 불꽃숭이, 팽도리 중 처음에 선택하지 않은 2마리를 얻을 수 있다.

이전 세대의 모든 스타팅: 축복시티, 무쇠시티, 꽃향기마을의 포켓몬센터에 있는 아나운서가 내는 퀴즈들을 풀고 배틀에서 승리하면 이전 세대의 모든 스타팅 포켓몬을 획득할 수 있다. 즉 축복시티에서는 5레벨의 이상해씨/파이리/꼬부기를, 무쇠시티에서는 10레벨의 나무돌이/야차모/물짱이를, 꽃향기마을에서는 15레벨의 치코리타/브케인/리아코를 얻게 되며 이들은 각자의 타입에 따라 기적의씨/목탄/신비의물방울 중 하나를 지니고 있다. 만약 엔트리가 가득 차서 받을 수 없다면 포켓몬들을 PC에 넣은 뒤 다시 말을 걸면 나머지 포켓몬들을 준다.

베이비 포켓몬: 축복시티의 트레이너 스쿨에 있는 카우걸 NPC에게서 포켓몬 알을 하나 받을 수 있으며, 이 알에서는 1레벨의 피츄, 삐, 푸푸린, 토게피, 배루키, 뽀뽀라, 에레키드, 마그비, 루리리, 마자, 꼬몽울, 랑딸랑, 꼬지지, 흉내내, 핑복, 먹고자, 리오르, 타만타 중 하나가 무작위로 부화한다.

라프라스: 들판시티의 민가 중 하나에 있는 할머니 NPC로부터 35레벨의 라프라스를 받을 수 있다.

폴리곤: 영원시티 갤럭시단 빌딩의 최상층에서 간부 주피터를 쓰러뜨린 뒤 바닥에 놓인 몬스터볼 안 22레벨의 폴리곤을 데려갈 수 있다. 폴리곤을 진화시키는 아이템인 업그레이드는 연고시티에서, 괴상한패치는 장막시티에서 얻을 수 있으며 나중에 선단시티에서 살 수도 있다.

화석 포켓몬: 영원시티 포켓몬센터 오른쪽에 있는 지하아저씨의 집의 여성 NPC에게서 비밀의 호박 1개와 각 종류의 화석 3개씩을 얻을 수 있다. 만약 무쇠시티 박물관에서 비밀의 호박을 복원하여 프테라를 엔트리에 넣은 후 다시 그 NPC에게 돌아가면 기술머신 80번 스톤샤워를 준다.

메탕: 무쇠시티에서 탄갱으로 가는 길 오른쪽 집의 성호로부터 10레벨의 메탕을 받을 수 있다.

팬텀: 숲의 양옥집 2층의 방에서 붉은 눈동자가 주인공을 쳐다보는 액자를 선택한 뒤 그 방에서 나가려고 할 때 20레벨의 팬텀이 출현한다. 이 이벤트는 한 번만 발생하므로 포획을 위해서는 반드시 저장을 해두자.

화강돌: 208번도로의 NPC로부터 쐐기돌을 받은 뒤 209번도로의 신령탑에 쐐기돌을 꽂으면 30레벨의 화강돌이 출현한다.

한바이트: 206번도로 아래의 미혹의 동굴에서 마지막 방에 들어가면 지진이 일어나면서 25레벨의 한바이트가 출현한다. 이 이벤트는 한 번만 발생하므로 포획을 위해서는 반드시 저장을 해두자.

로토무: 숲의 양옥집에 있는 TV를 선택하면 20레벨의 로토무가 출현한다. 기존과는 달리 반복할 수 있으며 언제든지 이벤트를 개시할 수 있다.

프리져: 깨어진세계 이벤트 이후, 천관산 꼭대기 즈음에 있는 포탈에 말을 걸면 60레벨의 프리져가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

썬더: 깨어진세계 이벤트 이후, 골짜기발전소 뒤에 있는 포탈에 말을 걸면 60레벨의 썬더가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

파이어: 깨어진세계 이벤트 이후, 챔피언로드에서 기술머신 악의파동을 얻던 곳에 있는 포탈에 말을 걸면 60레벨의 파이어가 출현한다. -PTSD- 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

뮤츠: 엔딩 이후, 파이트에리어의 포켓몬센터에서 odd invitation을 받고, 무쇠게이트 지하 왼쪽 끝(기존에서 힘껏펀치를 얻던 곳)에 있는 포탈에 말을 걸면 70레벨의 뮤츠가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

뮤: 엔딩에 상관 없이, 오랭열매를 소지한 채로 201번도로에 있는 버섯꼬에게 말을 걸면 뮤로 변한다. 이후, 자뭉열매를 서지한 채로 209번도로에 있는 이어롭에게 말을 걸면 뮤로 변한다. 이후 숲의양갱을 소지한 채로 축복시티 바로 위에 있는 호수 안쪽에 아차모에게 말을 걸면 뮤로 변하고, 201번도로로 가서 파치리스에게 말을 걸면 잡을 수 있다.

라이코: 깨어진세계 이벤트 이후, 208번도로에서 락클라임하면 있는 포탈에 말을 걸면 60레벨의 라이코가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

엔테이: 깨어진세계 이벤트 이후, 211번도로에서 락클라임(원작에서 기술머신 사이코키네시스를 얻던 곳)하면 있는 포탈에 말을 걸면 60레벨의 엔테이가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

스이쿤: 깨어진세계 이벤트 이후, 213번도로에서 파도타기하면 있는 포탈에 말을 걸면 60레벨의 스이쿤가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

루기아: 엔딩 이후, 영원시티에서 오박사의편지를 받은 다음, 전설의 3새를 모두 파티에 넣고 QUESTS을 선택하면 오박사가 은빛날개를 준다. 이후 219번수로로 파도타기하면 있는 포탈에 말을 걸면 70레벨의 루기아가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

칠색조: 엔딩 이후, 영원시티에서 오박사의편지를 받은 다음, 전설의 3개를 모두 파티에 넣고 QUESTS을 선택하면 오박사가 무지개빛날개를 준다.이후 로스트타워 꼭대기에 있는 포탈에 말을 걸면 70레벨의 칠색조가 출현한다. 죽이거나 도망쳐도 사라지지 않는다.

세레비: 이벤트와 상관 없이 봉신마을의 사당에 말을 걸면 GS볼을 얻는다. 이후 영원의숲으로 가면 GS볼이 흔들리면서 세레비가 나타나고 영원의숲 전역에 붉은색 포탈이 나타난다. 붉은색 포탈에 말을 걸면 45레벨의 트레이너들이 싸움을 걸어오고 이기면 세레비가 나타났다 사라진다. 이 포탈은 총 8개며, 모두 이기면 맵 중앙에서 세레비를 잡을 수 있다.

레지락: 상술했듯이 레지기가스가 필요없고 대신 고래왕(213번, 222번, 223번, 230번도로에서 대단한낚싯대로 5~10%)과 시라칸(봉신마을 호수와 226번도로에서 낚싯대 상관 없이 10%)이 필요하다. 그 외에는 원작이랑 같다. 228번 도로에서 잡는다.

레지스틸: 강철섬 출구 직전의 방에서 잡는다. 그 외에는 레지락과 동일.

레지아이스: 영원시티에서 선단시티로 가는 천관산에서 잡는다. 그 외 레지락과 동일.

대굴레오: 무쇠시티에서 포니타를 주고 대굴레오를 받을 수 있다. 3V(HP 공격 특공)이며 성격은 냉정.

스콜피: 꽃향기마을에서 체리버를 주고 스콜피를 받을 수 있다. 3V(공격 방어 스피드)이며 성격은 명랑.

페라페: 영원시티에서 눈꼬마를 주고 페라페를 받을 수 있다. 3V(특공 특방 스피드)이며 성격은 조심.

잉어킹: 226번도로에서 잉어킹을 주고 잉어킹을 받을 수 있다. 6V이며 성격은 고집.

208번도로에서 연고시티에 처음 진입할 때, 게이트에서 사천왕 충호와 만난다. 배틀을 선택할 수 있는데,[157] 엔트리 레벨은 전원 31. 생각없이 붙게 되면 사천왕답게 빡센 편이다. 다만 배틀을 신청하기 전에 충호가 엔트리의 모든 포켓몬을 회복시켜주고, 승패와 관계없이 기술머신 81번 시저크로스를 준다.

장막시티 백화점 5층에서 사천왕 들국화와 만나 대화를 하면 들국화가 기술머신 26번 지진을 준다.

신수마을에서 신수유적으로 들어갈 때 사천왕 오엽이 유적에서 나와 기술머신 29번 사이코키네시스를 준다.

물가시티에서 사천왕 대엽이 마을 안내를 마친 뒤 기술머신 50번 오버히트를 준다.

연고시티의 포핀하우스에서 남성 NPC에게 화상치료제를 하나 주는 것으로 기술머신 55번 열탕을 얻는다.

신수유적에서 비전머신 안개제거를 획득한 다음 지하 1층의 탐험가 NPC에게 말을 걸면 구애스카프를 준다.

체육관 배지를 5개 이상 얻은 상태라면 216번 도로에 있는 산장의 남성 NPC에게서 기술머신 13번 냉동빔을 획득할 수 있다.

꽃향기마을 포켓몬센터의 오른쪽에 위치한 민가에 있는 NPC로부터 특정 포켓몬의 전용 도구들을 획득할 수 있다. 즉 파티에 피카츄가 있다면 전기구슬을, 파오리가 있다면 대파를, 탕구리나 텅구리가 있다면 굵은뼈를, 럭키가 있다면 럭키펀치를, 메타몽이 있다면 금속파우더와 스피드파우더를, 진주몽이 있다면 심해의이빨과 심해의비늘을 얻게 된다.