(2020년 기준)교실이 있는 건물은 5층까지 있다.현재 2층에는 1학년 교실이 4개가 있다.3층에는 1학년 교실 5개,2학년 교실이 1개 있으며 4층에는 2학년 교실 8개 5층에는 3학년 교실이 9개가 있다. 3층에 교장실이 있으며 4층에 학생부실이 있다. 1층에는 과학실이 2개와 체육활동실, 특수교실, 진로활동실, 다목적실과 실습실이 있다. 2층에는 정보실과 Wee클래스, 3층에는 도서실과 기술실, 학생자치실, 인성복지실이 있고, 4층에는 미술실과 동아리실이 있다. 5층에는 음악실과 수학연구실이 있다. 운동장은 인조잔디를 사용하고 있다.

체육관은 건물안으로 들어가서 계단을 타고 올라가는 구조가 아니라 밖에 계단이 있다.밖에 있는 계단을 올라가면 체육관이 있다.아래에는 대부분 학교가 급식실이 있겠지만 급식실이 아닌 주차장이 자리하고있다. 급식은 후문 쪽에 위치한 급식소에서 교실로 배차받아 먹는다. [4]

2019년 2월부로 내진설계 등의 추가 보수공사가 완료되었고 미술실이 완공되었으며, 외부가 전체적으로 금속 질감의 건물로 바뀌었다.

통칭 시금치[10]. 별명이 이런 이유는 특유의 진한 초록색 때문.[11] 예전에는 하복이 없었지만 현재는 무상교복 지원으로 기존의 생활복과 하복을 통합하여 시원한 재질의 옷으로 만들어졌다. 동복은 마이, 가디건 두 가지가 있는데 학생들 대부분은 가디건을 입는다[12] . 마이는 두꺼워서 움직이는 데 불편한 점이 많이 있기 때문 .

체육복은 바지는 청록색으로 모두 같고 상의는 몸판은 청록색, 팔부분은 흰색이며 입학년도에 따라 가슴부분과 손목에 있는 무늬의 색이 노랑, 파랑, 남색으로 다르다. [14]

남동중학교 바로 옆에 인천담방초등학교가 있다. 때문 담방초등학교 졸업생 대부분은 자연스럽게 남동중학교에 입학하는 경우가 많다.

9대 이영우 교장의 임기가 유독 짧은데 그 이유는 2011년에 진행된 교장공모전 투표를 통해 교장이 바뀌었기 때문이다.

주변에 생각보다 놀 것이 많이 없다. 500미터쯤 떨어져있는 남동초등학교 근처에 가야 그나마 학원과 카페, 독서실이 있다.

제2 외국어를 배우는 대신 1학년때 한문을 배우며 도덕이나 역사같은 과목은 2학년때 배우게 된다. 특히 1학년때는 자유학년제를 시행하기에 다른학년과는 다르게 진로와 직업, 정보, 보건과목을 배우게 된다. 또 1학년에는 사회를 배우지만 2학년때는 역사를 배우게 되며 3학년때는 이 둘 다 배우며 모두 시험 과목에 해당하게 된다.[16]

매년 학년 말에는 '남동제'라고 하는 학교축제가 열린다. 주로 숭덕여자고등학교 강당에서 진행하였지만, 2019년는 해당 학교의 강당 공사로 인해 교내 강당에서, 2020년는 코로나19로 인해 진행하지 않고 온라인으로 작품을 전시하였다.

주변에 인천대공원으로 이어지는 장수천이 있어서 매년 봄, 가을즈음에 체육시간이나 스포츠시간을 이용해 벚꽃이나 단풍을 보며 학급 단체사진을 찍기도 한다. 수업 빼먹는게 은근히 즐겁다

복도 끝에는 급식차를 위한 급식소와 본 건물을 이어주는 엘레베이터가 있는데 가끔 교직원들이 타기는 하지만 모르는 학생들이 꽤 있다.

학교군 특성상 특성화고나 특목고같은 고등학교에 진학하지 않고 일반계 고등학교로 진학하게 된다면 남녀공학을 갈 수 없다.