2020년 6월 17일에 Pokémon GO의 메가진화가 예고되었으며, 8월 하반기에 업데이트가 확정되었다.

메가 레이드 등의 방법으로 획득 가능한 "메가 에너지"를 통해 8시간동안 메가진화가 가능하다. 메가진화시 현재까지 강화된 상태에서 메가진화하며, 메가진화 중에는 강화가 불가능하다. 메가 에너지의 요구량은 포켓몬에 따라 다르며, CP가 원본 포켓몬의 스탯에 따라 부스트된다. 메가 레이드 혹은, 리서치를 통해 메가 에너지를 모을 수 있으며, 1회 메가진화를 하고 나면, 필요한 메가 에너지 양이 80% 감소한다.

메가진화가 2가지인 경우 메가 에너지를 구분하지 않고 하나로 취급하되, 최초 진화 시 소모되는 메가 에너지는 별도로 취급한다.

메가진화한 포켓몬이 레이드에 나오면 해당 타입의 같은 아군의 기술 위력을 30% 부스트 시켜주는 효과도 있다. 타입이 같지 않은 기술일 경우 10%.

어떤 포켓몬이 메가진화를 할 시 해당 포켓몬과 같은 타입의 포켓몬과 레이드 보스를 잡을 시 잡은 포켓몬의 사탕을 1개 더 지급하는 효과가 있다.

다만 체육관 배틀에서는 지속시간 문제 때문에 방어팀에 배치할 수 없고, GO 배틀 리그에서는 밸런스 문제 때문에 참여가 불가능하다.

그림자 포켓몬과 복제 포켓몬,[1] 그 외 이벤트 한정 모델링을 가진 포켓몬은 메가진화가 불가능하다. 그림자 포켓몬은 공격력 부스트가 있기에 밸런스 상 당연한 조치지만 복제 포켓몬과 이벤트 포켓몬들은 왜 안 되는 지는 불명이다.[2]

메가 진화가 가능한 포켓몬 및 필요 메가 에너지를 정리한 표이다.

메가진화에 오직 메가레이드 클리어로만 얻을 수 있는 메가 에너지가 필요한 점과 메가진화의 지속시간이 8시간뿐인 점에 대해서는 평이 좋지 않다.

메가진화의 지속시간도 메가진화 에너지가 일부 포켓몬들에게 부담을 주기에 메가진화를 오랫동안 유지할 수 없는 것이다. 애초에 거의 모든 메가진화는 1티어 포켓몬들 밀어낼 정도로 강력하기에 메가진화의 요구 조건에 제재를 넣은 것으로 보인다.

이후 일부 포켓몬들에 한해서 필드리서치로도 해결할 수 있게 변경되었고, 일부 포켓몬들의 경우 스페셜 리서치와 이벤트 리서치로도 얻을 수 있게 되면서 수급 난이도는 이전보다는 낮아졌다. 파트너랑 걸어서 메가 에너지를 얻는 기능도 생긴 덕분에 메가진화의 평가는 이전보다 나아진 상황.

메가진화 업데이트와 함께 캐릭터 커스터마이징의 장갑에 오리지널 디자인의 GO메가뱅글이 추가되었다. 이것을 장착하지 않아도 메가진화는 가능하며, 단순한 코디용 아이템이다.

메가 레이드를 통해 수급 가능한 메가 에너지량이 증가했다. 기존에 55개가 최대였으나, 현재는 90개가 최대가 되었다. 또한 2회차 이후 진화 시 필요한 사탕 수도 감소했다. (50=>40, 25=>20) 이후에 메가 에너지 보유량이 포켓몬당 999개에서 2000개로 확대되고 지속 시간도 4시간에서 8시간으로 증가했다.

커뮤니티 데이 때 등장한 선글라스 거북왕과 할로윈 이벤트로 등장한 할로윈 코스튬 팬텀은 메가진화가 가능한데, 거북왕은 메가진화 시 선글라스가 없어지고, 팬텀도 코스튬이 없어진다. 물론 메가진화가 풀리면 복구된다.

0.199.0 업데이트 기준, 메가진화도감의 텍스트 오류가 발생한다. 메가이상해꽃, 메가리자몽X, 메가리자몽Y, 메가거북왕, 메가독침붕, 메가피죤투의 도감설명이 메가진화전의 텍스트로 출력되며, 메가팬텀, 메가갸라도스, 메가전룡, 메가헬가는 도감 설명의 중간중간 _x000D_ 라는 줄바꿈 에러가 발생해있다.