포켓몬스터 루비·사파이어부터 등장하는 포켓몬의 목록.

게임보이 어드밴스로 넘어가면서 과거 버전과의 통신 연동이 제대로 지원되지 않았기 때문에 시리즈를 새로 구성할 필요가 있었고, 그 때문에 리부트 비슷한 의미로 2세대보다 더 많은 포켓몬이 추가되고 독립적인 스토리라인을 가지게 되었다. 기존의 진화루트에 끼어드는 포켓몬의 숫자 역시 상당히 적으며[1] 구버전의 포켓몬들이 대부분 나오지 않는다.

그래서 포켓몬 도감이 특정 지역에서만 등장하는 포켓몬들이 나열되는 지역도감과 전국도감으로 나뉘어졌으며 그에 따라 포켓몬에게 붙는 번호가 도감에 따라 2가지로 나뉘게 되었다. 이 전통은 이후 세대에서 신규 지방의 자체적인 도감 설정이 확립되면서 계속 이어지게 된다. 지역도감 포켓몬 번호가 게임 플레이 중 야생에서 만나는 순서로 배치된 것도 여기서부터다. 다만 3세대 당시엔 이러한 구분의 과도기에 해당하던 시기로, 이 당시 호연도감은 전국도감에 있는 모든 포켓몬들의 번호가 배치되어있다. 이를 볼 조건은 각 시리즈의 전국도감 해금 조건[2]을 만족하지 않은 상태에서 호연지방 외에서 등장하는 포켓몬을 입수하면 된다. 예를 들어, 머나먼고도에 일찍 들어가 뮤를 포획할 경우 확인이 가능하다.[3] 해당 목록을 확인하고 싶다면 비노출 호연도감 문서 참고.

본격적으로 디자인 변경이 시작된 것도 이 때부터로, 서양권 수출을 위해 기존의 동글동글한 이미지의 점유율을 줄이고 조금 더 각지고 우락부락한 디자인으로 노선을 변경하기 시작했다. 특히나 과거에는 8비트였던 하드웨어의 한계 때문에 색상을 단순하게 배치할 수 밖에 없었으나 3세대에 와서 그런 제한이 없어져 좀 더 복잡한 색상을 사용할 수 있었던 이유도 있다. 그러나 컬러 디자인이 화려하거나 다채롭다는 느낌보다는 그냥 우중충하다는 느낌이 들기 때문에 5세대와 함께 디자인에 대한 호평보다는 혹평이 우세한 세대이기도 하다. 바로 뒤의 4세대나 가장 최근 나온 7세대 등과 비교를 해봐도 세련된 디자인이 적고 대짱이, 게을킹, 노공룡, 헌테일 등 비호감으로 느끼기 쉬우면서도 강렬한 개성있는 인상의 포켓몬 비율이 높은 것도 한 몫했다. 미형 포켓몬도 가디안, 뷰티플라이, 앱솔 등 손에 꼽는다.

비교적 그 숫자가 적었던 강철, 악, 고스트, 드래곤 타입의 포켓몬들과[4] 전설의 포켓몬들이 대거 추가되었다. 특히 신화속의 존재인 것 치곤 하나도 없던 드래곤 타입을 가진 전설의 포켓몬이 본격적으로 늘어나기 시작한 세대. 또한 보만다와 메타그로스를 통해 비전설 600족이 둘 이상 나오기 시작한 세대이기도 하고 600족 이상의 종합 스텟을 가진 비전설 포켓몬이 최초로 나온 세대이기도 하다.[5]

호연지방이 바다가 넓은 지방이다 보니 물 타입 포켓몬의 수가 전체 135중 20% 조금 넘는 28마리에 달한다. 그 다음으로는 에스퍼 타입이 20마리나 추가되었고, 뒤이어 노말, 풀 타입이 많이 추가되었다. 반면 전기 타입은 최종 진화형 기준 썬더볼트, 플러시, 마이농 이렇게 3마리뿐이고, 불꽃 타입은 번치코, 폭타, 코터스[6] 이렇게 3마리뿐이다. 독 타입과 고스트 타입도 5마리씩만 추가되었다. 6세대에 추가된 페어리 타입도 호연지방 포켓몬 중에는 가디안 계열과 입치트, 루리리에만 추가되었다. 더운 아열대 기후인만큼 얼음 타입도 얼음귀신, 씨카이저, 레지아이스 이렇게 3마리뿐이다. 하지만 얼음귀신과 레지아이스는 1~2세대에 없었던 단일 얼음 타입이다. 이러한 기후에 따른 얼음포켓몬 추가 수 여부는 신오지방과 알로라지방에서도 나타나게 된다.

또한 유난히 한칭이 변경된 포켓몬이 다수 존재한다. 이유는 SBS/대원씨아이에서 보유했던 국내 포켓몬 판권이 포켓몬코리아로 옮겨가면서 매체마다 다르게 번역했기 때문.

현재 페어리 타입이 추가된 포켓몬들은 5세대까지는 페어리 타입 없이 단일 타입으로 존재하였으나, 6세대에서는 페어리 타입이 추가된 형태로 있다.

시리즈 최초로 지방도감에 없는 포켓몬의 데이터가 없는 소드ㆍ실드에서는, 초반에는 4세대 이상으로 잔존률이 낮았지만 이후 왕관의 설원에서 뜻밖에도 3세대 스타팅이 귀환하면서 어느 정도 본전은 찾게 되었다. 게임 프리크 제작진 중에 딱히 3세대를 편애한다고 알려진 사람이 없음에도[7] 3세대 스타팅이 복귀했다는 건, 항상 1세대를 제외한 모든 세대를 박해하는 게임 프리크의 각 세대에 대한 대우가 그나마 조금은 평등해진 것으로 볼 수도 있다.

3세대의 포켓몬 게임은 오메가루비/알파사파이어 이전까지 대원미디어의 무능으로 한글화가 되지 않았던 점, 한국어판 애니메이션이 대망한 점[8] 등으로 인해 인지도가 낮다. 나이를 먹어 추억을 찾아 포켓몬 시리즈의 가장 최신 타이틀인 오루알사 등을 잡아봤다가 배틀하우스를 처음 보고서 이런 놈도 있었나 하는 사람도 있는 편.[9]

다만 골드/실버/크리스탈 버전 바로 다음에 출시된 게임이라 1세대 애니메이션부터 포켓몬스터를 접한 원조 포켓몬 세대들에게는 골드 및 실버버젼 특수와 더불어 성도지방편 특수에 힘입어 그나마 잡아본 사람들이 꽤 되는 편이다.[10] 하지만 1,2세대부터 잡은 코어유저와 4~5세대로 유입된 사람의 수가 압도적으로 많은 한국의 포덕 구조 특성상 리메이크 전의 3세대(RSE)부터 입문한 포덕은 현저히 드문 극소수. 3세대로 시작한 사람들보다는 오히려 4세대 이후 나중에 와서야 3세대의 GBA판 알팩이나 중고팩을 구해서 해 본 사람들이 더 많은 편.[11] 이것때문인지 리메이크 전까지는 꼬부기, 리아코, 팽도리는 잘 알면서 물짱이는 모르는 등 3세대의 포켓몬은 본 적도 알지도 못하는 유저가 많았다.

실제로 1, 2세대였을 때 포켓몬 팬이 된 이들의 대부분은 3세대 게임에 잠깐이나마 관심을 가졌을지언정 4세대부터는 3세대에 대한 실망으로 인해 완전히 사라지고 말았다.

그러나 3세대 리메이크가 되면서 gba 버전의 루비, 사파이어, 에메랄드도 거의 제대로된 한글패치가 이루어졌다.[12]

그리고 1, 2세대 때의 착착 감기는 번역은 어디가고 3세대부터 한칭 번역 센스가 떨어져가고 성의없는 직역이 늘어간다는 불만이 조금씩 커지기 시작했다.

물론 포켓몬스터 게임 시리즈의 한국 게이머들은 타 게임에 비해 절대 다수의 게이머들이 애니메이션을 통해 한글판 번역을 먼저 접하여 한글화에 대한 반감이 적다는 기이한 축에 속하지만[13] 이왕 현지화를 할 것이면 기존 시리즈의 코드를 그대로 계승한 것이 옳은 방법이다.

특히 이 한칭에 반영되지 않은 (그러나 1, 2세대엔 반영됐던)일칭의 센스를 호소하는 문제와 성의없는 직역의 문제에 대한 팬들의 불쾌함은 포켓몬 명칭의 번역을 맡은 SBS(1, 2세대)→대원미디어(3세대)→한국닌텐도(3세대 이후 모든 시리즈) 체계를 거치면서 꾸준히 누적되어 결국 5세대에서 제대로 폭발하고 말았다(…).

3세대 202마리, 6세대 211마리.

3세대 시절에는 6세대 시절에 비해서 4세대 및 그 이후에 추가된 포켓몬이 빠지고 현재도 환상의 포켓몬인 지라치, 그 당시 환상의 포켓몬이였던 테오키스를 제외하면 레쿠쟈에서 딱 200번으로 끝난다.[108]

3세대의 경우 이 이후의 도감번호는 포켓몬스터/목록/3세대/비노출 호연도감 참고.