333번이 폐지되면서 이를 대체하기 위해 2016년 4월 1일에 신설되었다. 창원시 공지사항

2017년 9월 15일에 바로 웅동배후부지로 가지 않고 신항만한진해운을 경유하는 걸 바뀌었으며 '부영8단지 - 애플타운 - 신항국제물류' 구간이 '부영8단지 - 부영4단지 - 동방물류센터 - 현대물류 - 신항국제물류'로, '웅천대교 → 에스에이치아이 → 포스텍지엘시→ 웅천대교' 구간이 '웅천대교→ ENK/한진중공업 → 경일글로벌로지스틱스 → HND로지스틱스 → 칼트로지스/SKU → 동영로지스틱스 → 포스텍지엘씨 →웅천대교'로 변경되었다. 창원시 공지사항

2020년 4월 1일에 '용원사거리 - 말무교 - 부영8단지' 구간이 '용원사거리 - 부산카프링 - 경제자유구역청 - 동방물류센터 - 부영8단지'로 변경되었다. 창원시 공지사항

옛 진해공영버스가 2015년 12월 1일에 진해마을버스로 명칭을 변경한 이후 처음으로 신설된 노선이자 진해마을버스 노선 중 유일하게 차량이 2대가 투입되는 노선이다. 333번이 이지더원까지 운행해왔던 것에 반해 353번은 웅천대교를 지나 웅동경제자유구역까지 운행하는 것과 더불어 웅동경제자유구역으로 들어가는 최초의 노선이다.

이 노선은 중간에 부산광역시 강서구 가덕도를 잠시 경유하게 되며 굴곡으로 가는 특성도 있다.