아프간과 인도와의 관계는 매우 오래되었다. 20세기에 아프간이
바라크자이 왕조시절에 인도는
영국령 인도 제국이었기 때문에 외교관계가 아예 없었다. 독립 직후에 아프간과 인도는 공식 수교했고 양국은 각각 대사관을 세웠다. 1970년대에 아프간이 내전이 일어나고
아프가니스탄 민주 공화국이 세워지면서 양국관계는 단절되었다.
탈레반 정권이 세워졌을 때에도 인도와의 관계는 아예 없었다. 2001년에 탈레반 정권이 무너지자 양국관계는 회복되었다. 그리고 양국간에 대사관도 개설되었다.
아프간이 탈레반에 의한 테러가 발생되다보니 대사관에서도 테러가 발생되고 있다. 2008년에는 카불의 인도 대사관에서
폭탄 테러가 발생되었다. 2009년에도
폭탄 테러가 발생되었다.