경남 FC 소속의 축구선수로, 포지션은 수비수.

잠원초, 남대문중, 장훈고, 한양대를 거치며 축구를 배운 유지훈은 2009년 K리그 드래프트에서 경남 FC의 번외 지명으로 입단하게 되었다. 하지만 경남에서는 그리 많은 경기를 뛰지도 못하고 방출되었으며, 이후 팀을 찾아 백방으로 돌아다니다가 안익수 감독의 부름을 받아 2011년 부산 아이파크에 정식으로 입단하게 된다.

부산은 그해 있던 K리그 승부조작 사건의 여파로 수비수 4명이 퇴단하여 한창 보강에 열을 올리고 있었으며, 유지훈은 이 자리를 꿰차 2012년에는 주전으로 도약할수 있었다.

이후 2013년부터 2014년까진 상주 상무에서 병역의무를 이행하였고, 이때 당시 2부리그인 K리그 챌린지로 처음 내려간 상주를 첫해에 우승으로 이끌며 트로피를 들어보는 경험도 하게 된다, 그 뒤로 2015년에 부산으로 복귀하여 상주에 가기 전처럼 주전으로 활약하는듯 했으나, 시간이 지날수록 구현준 등에게 밀리며 2017년에는 로테이션 정도로 밀려나게 된다.

결국 유지훈은 2017년 여름 이적시장에서 서울 이랜드 FC로 이준희와 트레이드되어 이적하고, 서울 이랜드에서는 반시즌+반시즌 도합 1시즌 동안 22경기 출전 1도움의 성적을 기록한다. 그 후 2018년 여름 이적시장에서 자신이 처음 프로 생활을 시작한 경남 FC로 이적하여 현재에 이르게 된다.