1979년 창단되어 1980년까지 2년이라는 짧은 기간 동안 야구부가 존재했다. 훗날 LG 트윈스에서 투수로 활약한 김태원이 이 학교에 있다가 팀이 해체되면서 배재고로 전학했다. 같은 재단의 우신중학교에서는 오승환이 몸담았다.[2]

그러다가 2019년 서울고 조태수 투수코치를 감독으로 선임하고 20명의 학생을 전학받은 후 야구부를 재창단했다.[3] 당초에는 2018년 참가하고 인천권으로 들어가기로 했으나 준비가 되지 않아 재창단을 1년 미뤘다.[4] 우신고등학교가 위치한 서울 서부권 지역은 오랫동안 야구부가 없었는데, 그렇기 때문에 고교야구 확장의 측면에선 여러가지 의의가 있는 셈이다.

신생팀의 한계를 보이고 있지만, 그럼에도 2019 고교야구 주말리그에서 청원고등학교 야구부를 상대로 첫 승을 거두었다. 청룡기 전국고교야구대회 1회전에서는 광주동성고를 상대로 선전했으나 6-9으로 아쉽게 패했다. 대한야구소프트볼협회장기 전국고교야구대회 1회전에서는 인천동산고에게 첫 승을 거두는가 싶었으나 2-3으로 역전패했다.

8월 12일 있었던 봉황대기 1회전에서 물금고등학교 야구부를 만나 9-10으로 졌다. 2020년 한기주가 투수코치로 부임했다.

2020년 6월 15일 목동야구장에서 열린 황금사자기 대회에서 강원고등학교 야구부를 1회전 상대로 만나 0-7로 패했다.

주말리그에서 1승 6패를 기록했고, 협회장기에 출전하게 되었다. 2020년 8월 24일 32강전에서 대전고등학교 야구부를 만나 1-3으로 패했다.