지간선제 시행으로 260번을 부여받았으며 당시엔 수산리가 종점이고 연기리가 기점이었다.

기점이 연기리에서 조치원역으로 연장되었다.

2013년 4월 1일 시내버스 노선 개편으로 260번이 8회에서 3회로 감회되고 연기리와 수산리를 6회 왕복 운행하는 261번이 신설되었다.

2013년 6월 10일 2013년 제2차 시내버스 노선 개편으로 조치원역/연기리~은하수공원 노선인 240/241이 노선과 통합되어 260번이 1회 증회되고 260/261번 노선이 은하수공원으로 연장되었다.

2014년 2월 24일부터 261번 노선이 폐지되고 260번 노선이 4회 증회되어 하루에 8회 운행하게 되었다.

2018년 4월 27일에 노선번호가 260번에서 16번으로 변경되었다. 세종시 공지사항

2020년 7월 1일에 조치원역에서 조치원터미널로 연장운행을 시작했다. 비공식 조여중, 세종고 지원운행은 그대로 운행하나 터미널까지 갔다오고나서 들린다고 한다. 기존보다 더 돌아가는 셈이다.

행정중심복합도시의 장묘 시설인 은하수공원으로 가는 유일한 노선이었다. 지금은 1005번 버스가 2018년 12월 개통하면서 기점이 은하수공원으로 확정되자 이 타이틀은 사라지게 되었다. 1005번의 개통으로 인해 은하수공원으로 들어오는 버스 운행횟수가 대폭으로 늘어났다.

은하수공원에서 7시 45분에 출발하는 차량은 조치원여자중학교 및 세종고등학교 통학생 편의를 위해 주유하러 가는 길에 해당 학교에 학생들을 내려준다. 배려 차원인 듯.

참고로 정류장명을 세종교통 운영 노선과 다르게 지칭하는 곳이 몇 군데 있으니 주의해야한다. 세종교통 운영 노선들이 세종교통이라 하는 정류장이 봉암1리로 바꿔 안내하거나, 죽림리(독립주유소)에서 독립주유소를 지워서 죽림리로 안내하거나, 실광주유소 정류장을 연기사거리로 바꿔서 안내하는 경우 등이 있다.

소요시간은 35분이므로 1, 2, 8회는 35분이 아닌 30분으로 되어있다.

일반 철도역: 조치원역(ITX-새마을, 무궁화호, 누리로)