2009년 7월 1일에 9200번에서 분리되었다. 인강여객에서 BMS에 9000번은 9200번으로 등록하여 운행하는 바람에 어플이나 ARS로는 9000번이 조회되지 않았다.

연수구청 구간이 많이 우회한다는 이유로 '연수구청~동막역' 구간이 '송도~동막역'으로 변경되었다.

2010년 1월 3일에 경기고속으로 이관되었다. M6405번의 개통으로 9000번의 존재가 무의미한 바람에 경기고속으로 넘긴 거라는 의견이 지배적이다.

2011년 3월 3일에 폐선되었다.

경기고속에 인수되면서 분당신도시로 가는 9000번과 번호와 운영사가 완전히 중복되었다. 그리하여 GBIS에서는 구분을 위해 '9000(인천)'으로 표기하다 번호 검색의 어려움으로 '9000-1'로 표기하였다.

경기고속이 인수한 뒤에도 정차하는 정류장의 변화는 없어서 경기도 내 정류장은 선바위역이 전부였다.

폐선된 후 9000번의 인가는 6501번의 개통에 활용되었다.

KD 운송그룹이 인천광역시에는 차고지를 두지 않아서 용현동 구 터미널에 차량을 주박하였다.

파일:Incheonmetro1_icon.svg 인천 도시철도 1호선 : 테크노파크역, 캠퍼스타운역, 동막역, 동춘역

파일:Seoulmetro2_icon.svg 서울 지하철 2호선 : 서초역, 교대역

파일:Seoulmetro3_icon.svg 수도권 전철 3호선 : 교대역, 양재역

파일:Seoulmetro4_icon.svg 수도권 전철 4호선 : 선바위역