신오지방에 나타난 또 하나의 세계
시간에도 공간에도 지배 받지 않는 또 하나의 세계
포켓몬을 모으고 키워, 신화의 포켓몬이 기다리는 새로운 여행을 시작하자!

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― 패키지 뒷면 문구

• 일부 배경이 겨울로 교체되었으며[5] 주인공 및 라이벌의 복장도 동복으로 교체되었다.[6] 또한 스타팅 포켓몬을 받을 때 전작에서 남의 포켓몬을 무단으로 사용한 게 문제가 되었는지, 이번 작에서는 시리즈 전통 대로 주인공과 라이벌이 마박사에게 스타팅 포켓몬을 받는 방식으로 진행되었다.[7] 그리고 체육관 관장과 사천왕, 난천 등의 포켓몬도 일부 변경 되었다.
  

• 4세대의 진정한 완성작이라고 생각될 정도로 정말 시스템이 잘 개선되었다. 전작의 여러가지 문제점을 완벽하게 수정하고 스토리도 보완하여 높은 평가를 받았다. 파도타기 속도가 빨라졌고, 오야지기 시스템이 생기고, 배틀에서 딜레이가 거의 사라져 긴장감 있는 템포로 배틀을 진행할 수 있다. 플레이 속도는 여전히 3세대에 비하면 느리지만 전작에 비하면 훨씬 빠른 수준이다. 게이머들이 고쳐졌으면 하는 문제점을 소름 돋게 잘 찝어내어 수정하고 여러가지 즐길 요소를 추가하여 한 층 더 재미있게 게임을 즐길 수 있다. 다만 전작의 긴 세이브 타임은 크게 달라지지 않았다.
  

• 신오 도감도 150마리였던 전작과 달리 210마리로 대폭 증가했다. 마그마번, 에레키블 같은 특이한 방식으로 진화하는 4세대 진화형을 수용함에 따라 진화트리가 딸려오게 되어 전력이 대폭 강화되었다. 이로서 플레이어가 쓸 만한 불꽃 포켓몬이 초염몽과 날쌩마밖에 없는 불꽃 포켓몬 기근 사태, NPC 트레이너가 전문 타입이 아닌 엉뚱한 포켓몬을 들고 나오는[9] 일도 사라졌다.
  

• 역대 시리즈 중 네임드들의 엔트리가 가장 탄탄하다. 전작들의 경우 포켓몬이 부족해 같은 진화트리를 사용하거나 자신의 전문 타입과 상관없는 포켓몬들을 사용하였으나 이번 작부터는 충호의 드래피온 빼고 없다. 그 드래피온도 진화 전 스콜피의 벌레타입이 악타입으로 변한 것이다. 뿐만 아니라 엔트리도 강화되어 관장들 모두 자신의 상징이라는 포켓몬이 맥실러의 플로젤을 제외하면 모두 평범하게 입수할 수 없다.[11]또한 첫 관장 강석을 제외하면 모두 히든 카드가 최종 진화형이다. 사천왕 역시 모두 1차전부터 최소 준 메이저 급 포켓몬만 내보낸다. 2차전에 엔트리를 강화하지 않은 이유는 할 필요가 없는 것에 가깝다. 이는 주요 악역인 갤럭시단도 마찬가지. 전 작에 야생 포켓몬 수준의 레벨정도인 포켓몬이나 데리고 나오는 조무래기도 일반 트레이너 급으로 대우가 좋아졌으며 니로우 등 전 작에는 간부 급이나 사용했던 포켓몬을 데리고 나온다. 전 작인 루비/사파이어/에메랄드에서 마그마단과 아쿠아단의 포켓몬이 3종류 뿐이며 레벨이 야생 포켓몬과 다를 바 없었던 것에 비하면 매우 강화 되었다. 간부 역시 전용 BGM과 상징하는 포켓몬들을 데리고 나오며 확실한 개성이 생겼다. 보스인 태홍도 단원들과는 다른 메이저 포켓몬들만 데리고 나온다. 기라티나로 포켓몬을 접한 이 들은 이 다음 리메이크 작인 하트골드 & 소울실버에 신오지방 동네 초딩만도 못한 네임드들의 포켓몬들을 보면 의아해 할지도 모른다.
  

• 신 캐릭터로 국제경찰인 핸섬과 갤럭시단의 새로운 간부인 플루토가 추가 되었다. 저 두 캐릭터들은 Pt의 주요 떡밥 중 하나이다.
  

• 스토리가 크게 변경되었으며 그 영향으로 갤럭시단, 특히 태홍의 행보 역시 많이 변경되었다. 메인이 기라티나가 된 만큼 깨어진세계라는 신 던전도 추가되었다. 스토리도 주인공이 메인 전설의 포켓몬을 잡으면 너무나도 쉽게 물러나서 진이 빠졌던 전작과 달리 태홍의 비중이 늘어났으며, 하드마운틴에서 갤럭시단 스토리의 후일담도 추가되었다. 그 덕에 전작에선 엔딩 후에나 갈 수 있었던 송별의 샘, 귀혼동굴을 갤럭시단 이벤트 후에 갈 수 있도록 변경 되었으며 그에 따라 주변 지역의 포켓몬 레벨도 낮아졌다.[13] 전작 디아루가에서는 디아루가만 포획 할 수 있고 펄기아에선 펄기아만 포획할 수 있는 것과 달리 천관산에 숨겨진 금강옥, 백옥만 들고 가면 두 포켓몬을 모두 포획할 수 있게 되었다. 또한 전국도감으로 업그레이드 후에는 파이어, 프리져, 썬더를 포획 할 수 있게 되었다.
  

• 이외의 세세한 스토리 변경으로 장막시티와 들판시티 체육관 클리어 후 연고시티 체육관을 클리어 할 수 있었던 전작과 달리 연고시티에 도착하자 마자 연고시티의 체육관 배지를 얻을 수 있게 되었다. 강철섬의 경우는 전작은 반드시 들러야 하는 곳이 아니었지만, 이번엔 반드시 들러야 하는 곳으로 변경되었다. 강철섬에 등장하는 갤럭시단 때문에 설정 충돌을 피하기 위한 것인 듯.
  

• 배틀타워도 포켓몬스터 에메랄드처럼 배틀프런티어로 교체되면서 배틀타워를 포함해 즐길거리가 엄청 늘어났다. 따라서 프런티어 브레인도 같이 등장했다. 또한 서바이벌에리어에 있는 맥의 집에서 신오지방의 관장 및 NPC와 재 대결 하는 것도 가능해졌다.
  

• 필드도 일부 개편 되었다. 떡잎마을에 추운 지역임을 표현하는 눈이 쌓여 있고, 일부 도시의 바닥 색이 바뀌었다. 리조트에리어 같은 경우엔 별장처럼 새로운 필드가 추가 되기도 했으며, 상호교류광장도 순간이동 시스템이 추가되는 등 맵 구조가 변경되었다. 풀밭 같은 경우도 포켓트레를 활용하기 쉽게 잘 보이는 형태로 변경 되었다. 장막시티에는 백화점에 포핀과 나무열매를 살 수 있는 지하가 생겼다. 일부 체육관 미로도 개편 되었다.
  

• 콘테스트 댄스 음악이 전작에선 이지, 하드만 나뉘어 총 2개였지만 이번엔 콘테스트의 테마에 따라 총 5개의 곡으로 변경 되었다. 각 곡이 콘테스트의 테마를 잘 나타내 주어 호평을 받는다.
  

• 216~217번도로에 눈보라가 훨씬 더 강해졌다. 자세한 건 문서 참조.
  

• 일부 일반 트레이너들이 볼 캡슐을 사용한다.
  

• 일부 물건을 세트로 구매할 수 있게 되었다. 예를 들어 신수마을 위쪽의 카페에서 파는 튼튼밀크를 전작인 포켓몬스터DP 디아루가·펄기아에서는 일일이 하나하나 구매 해야 해서 여간 귀찮음이 아니였지만 Pt에서는 튼튼밀크 1세트를 추가로 구매 할 수 있다.
  

• 이상해씨, 이상해풀, 이상해꽃
  
• 파이리, 리자드, 리자몽
  
• 꼬부기, 어니부기, 거북왕
  
• 뮤츠
  
• 치코리타, 베이리프, 메가니움
  
• 브케인, 마그케인, 블레이범
  
• 리아코, 엘리게이, 장크로다일
  
• 라이코, 앤테이, 스이쿤
  
• 루기아, 칠색조
  
• 나무지기, 나무돌이, 나무킹
  
• 아차모, 영치코, 번치코
  
• 물짱이, 늪짱이, 대짱이
  
• 라티아스, 라티오스
  
• 가이오가, 그란돈, 레쿠쟈
  

• 삐, 삐삐
  
• 푸푸린, 푸린
  
• 나옹
  
• 핑복, 럭키
  
• 메타몽
  
• 이브이
  
• 루리리, 마릴
  
• 플러시, 마이농
  
• 캐스퐁
  
• 꼬지지
  
• 흉내내
  
• 피츄, 피카츄[25]
  

• 2014년 5월 20일 오후 11시 이후로 닌텐도 DS와 Wii의 와이파이 커넥션 서비스가 종료되면서 4, 5세대 포켓몬 시리즈에서의 GTS 등의 서비스도 이용할 수 없게 되었다.
  
• 2014년 5월 3일부터 5월 20일까지 Twitch Plays Pokémon 시즌 5에서는 이 버전을 사용했다.
  
• 깨어진 세계를 갈 수 있는 유일한 버전이다. 7세대에 와서도 깨어진 세계만큼의 기묘한 중력은 느끼기 힘들다.
  
• 해외판 기기에 국내판 게임카드를 꽂으면 Pokémon Pt Giratina로 인식한다.
  
• 타이틀 화면,즉 기라티나가 나오는 부분에서 윗쪽 십자키+셀렉트+B버튼을 누르면 게임 데이터, 리포트를 삭제 할 수 있다.