유희왕 듀얼몬스터즈의 두 번째 스토리. 50화부터 97화까지 해당된다.

어둠의 유우기의 정체에 대한 힌트나 카이바 세토의 전생도 스리슬쩍 던져놓는 등 여러모로 중요한 스토리임에는 틀림없다. 그리고 이때부터 디스크가 보급되면서 시작 라이프 4000과 상급 소환에 제물을 바쳐야 하며 플레이어에 대한 직접 공격이 가능해 지는 등, 애니메이션의 룰이 OCG와 비슷하게 정립된다.[1]

배틀 시티를 무대로 세 장의 신의 카드를 가진 어둠의 유우기, 카이바 세토, 마리크 이슈타르의 삼각 구도와 예측할 수 없는 전개는 많은 사람들을 쫄깃하게 만들었고, 듀얼리스트 킹덤부터 시작한 유희왕 애니메이션 인기는 배틀 시티에서 그 정점을 찍는다. 현재도 왕의 기억 편과 맞먹는 유희왕 DM의 최고의 에피소드로 꼽힌다.