어머니를 죽이고, 아버지가 개발한 데빌 건담을 탈취, 지구로 낙하한 쿄우지 캇슈를 추격하던 도몬 캇슈[1]가 데빌 건담의 출현에 의해 붕괴한 신주쿠에서 스승이던 마스터 아시아와 연합해 신주쿠 난민을 지키기 위해 치른 전투이다. 마스터 아시아와 도몬은 신주쿠의 난민을 구출하고 데빌 건담 군단에 맞섰다.

하지만..........

신주쿠 전투 자체는 데빌 건담 측에 돌아선 마스터 아시아의 계략에 의해, 엉망이 된 신주쿠에서 벌어진 전투이다. 데빌 건담의 2차 진화 저지와 마스터 아시아의 척결, 신주쿠의 난민 구조를 목적으로 신, 구 셔플 동맹과 신주쿠의 방위대, 그리고 네오 도이치의 파이터 슈발츠 브루더[3]가 데빌건담에 맞선 전투로 구 셔플 동맹의 희생으로 새로운 셔플 동맹원들이 탄생했다.

하지만 마스터 아시아의 계략대로 데빌 건담은 2차 진화에 성공한 채로 마스터와 같이 사라졌으며, 폐허가 된 신주쿠를 앞에 두고 각국의 건담 파이터들은 뿔뿔히 흩어졌다. 또한 구 셔플 동맹은 모두 운명을 달리했다.