25번의 전신은 251번이고, 251번의 전신은 250-1번이다. 당시 250-1번은 영생관리사업소 - 도촌동 - 야탑역 - 이매역 - 럭키타운 노선으로 운행했다. 2012년 10월 14일부로 250-1번이 두 노선으로 분리되는데 그 과정에서 251번과 252번이 신설된 것이다. 251번은 야탑역 - 럭키타운 구간을, 252번은 영생관리사업소 - 야탑역 구간을 가져가게 된다.

2014년 9월에는 운수회사가 성남시내버스의 계열사인 성남여객버스에서 신도양(주)로 변경되었다.

2019년 5월 13일에 '럭키타운 - 돌마고 - 이매역 - 성남아트센터 - 야탑역' 구간이 '분당테크노파크 - 상탑파출소 - 대원빌라 - 하탑중 - 돌마초교 - 야탑역'으로 변경되며 동시에 번호도 25번으로 바뀌었다. [4] 단축구간은 성남형 공공버스 누리1번, 누리3번이 대체 운행 중이다. 성남시 공지사항 (pdf 파일)

코로나19 사태로 25번 마을버스의 수요가 60%이상 급감하여 2020년 4월 1일부터 한시적으로 운휴하게 되었다. [6]

원래 성남여객버스 출신 2004년식 글로벌900 가스차량으로 운행하다, 2015년에 대차되면서 2008년식 서울 마을버스 도색 현대 글로벌900 F/L 디젤차량으로 운행하다가 2020년에 이 차량도 대차되면서 현재는 75번 출신 뉴 슈퍼 에어로시티 F/L 디젤차량이 투입되어 투입되어 운행하고 있다.

과거 지선이었던 252번에 대한 내용은 해당 문서 참고.

운행사원 식사시간에는 배차간격이 1시간 가까이 벌어지기도 한다.

영덕여고 경유로 변경되지 않은 것에 논란이 좀 있는 편이다. 환승저항에다 60번 배차간격이 20분대으로 좋지 못하는 등 여러모로 교통이 안좋기 때문이다..... 현재 야탑역~테크노파크 구간에서는 8-1번과 50번, 57번의 분산 수요가 많은 편은 아니지만 나름 괜찮게 주워먹고 있는 중이다.

수도권 전철 수인·분당선: 야탑역