2016년 입단하는 신인과는 K리그 드래프트없이 전면 자유계약이 적용된다.

전년도에 이어서 KBS 1TV에서 생중계가 정기적으로 편성된다. 또한 KBS N 스포츠에서 시즌 초부터 중계가 편성되며, JTBC와 JTBC3 FOX Sports가 새롭게 중계방송을 시작한다. 그 외 SPOTV, tbs 교통방송 등을 통한 중계는 종전대로 진행된다. 그리고 MBC SPORTS+ 2에서도 5월부터 K리그 클래식 중계를 편성하고 있다.

K리그 산하 유소년 클럽에 소속된 선수는 원소속구단의 동의 없이 타 프로구단에 입단할 수 없도록 하는 규정이 신설되었다.

순위결정방식이 '승점→득실차→다득점'에서 '승점→다득점→득실차'로 변경됐다.

수원 FC가 클래식에 승격함에 따라 최초로 로컬더비(지역 더비)인 수원 더비가 열리게 되었다.