해군본부 직할 병원인 해양의료원은 대한민국 해군의 중앙병원으로 경상남도 창원시 진해구 자은동 진해 해군기지에 위치하고 있다. 현역 장병과 군무원, 군 가족, 10년 이상 복무한 예비역이 기본 진료 대상이며, 응급환자로 민간인도 진료할 수 있다.

1945년 해방병단 의무실으로 창설되어, 1948년 진해해군병원으로 개칭 후 1971년 국군의무사령부로 편입되었으나, 1971년에 창설한 해양의학적성훈련원과 함께 2000년에 해군본부로 배속되며 해양의료원으로 통합 및 재창설되었다.

2013년 5월 30일 경상남도 창원시 진해구 자은동 진해기지 일대에 4,600여평 규모로 신축 이전 했다.#

해의원에서 잠수함, 항공근무자의 기초적인 신체검사 등을 진행하기 때문에, 해군의 거의 모든 수상함, 잠수함, 항공근무자는 최소 이곳을 모두 한 번씩 거치게 된다.[1] 타 지역 해군 부대의 건강관리 업무도 담당하고 있으며, 일부 부대에 대해서는 출장 진료도 한다.

국군 병원은 최기(最嗜) 병원 진료가 원칙이므로 소속이 다르지만 경남에 위치한 공군교육사령부 혹은 제39보병사단 군인들의 1차 외진도 담당하고 있다(훈련병/교육생/후보생/기간장병). 여기서 안 되는 환자는 국군수도병원 혹은 민간 병원으로 보낸다.

진해기지사령부 내 구 해의원 자리에 위치한 해양의학지원소는 잠수의학 교육 및 연구기관으로, SSU(해난구조대), UDT/SEAL, UDU와 같은 잠수업무 종사자, 잠수함 승조원 등의 신체 검사, 잠수병 치료, 장비 테스트에 사용하는 재압챔버를 보유하고 있다.#[2]

신축 이전 전 해의원은 정말 열악했다... 80년대라고 해도 믿을 정도..[3] 새 병원은 천지가 개벽할 수준으로 바뀌었다. 이전 해양의료원 건물은 구 진해요항부 병원(등록문화재 제197호)로 지어졌고 증축이 이뤄진 건물이다보니, 과거 그대로의 흔적들이 매우 많다.#

2014년 기준 부대 이전을 하고 자리잡는데 정말 힘들었다. 부대환경은 좋아졌지만 드넓은 진해기지사령부(이하 진기사)의 복지시설을 누리지 못하는건 큰 절망이었다. 초반에는 주말에 진기사로 차량운행을 하면서 종교활동과 복지시설을 이용했다.[4]

지하 1층, 지상 4층인 해양의료원은 MRI, CT, 내시경, 암 표지자 검사 장비 등 의료장비를 고루 갖췄다.

KTX를 타고 올 경우 창원중앙역에서 하차해서 역 앞 버스정류장에서 752번 좌석버스를 타고 덕산해군아파트에서 하차해서(약 29분 소요.) 도보로 10분 정도 걸어가면 도착한다. 창원역에서 내렸다면 역 밖으로 나와 횡단보도를 건너 오른쪽으로 걸어가면 LG 유플러스 매장 앞에 버스정류장이 있는데 거기서 757번 좌석버스를 타고 덕산해군아파트 정류장 하차.(약 44분 소요) 10분 정도만 걸어가면 도착한다. 차라리 창원역보다는 창원중앙역에서 내려서 752번을 타고 가는 것이 시간이 더 단축되니 반드시 창원중앙역 정차하는 KTX를 예매하기 바란다.

일단 창원종합터미널에서는 한번에 바로 가는 버스 노선이 없고 1회 환승을 거쳐야 한다. 가장 빨리 가는 방법은 창원터미널 앞 버스 정류장에서 214번 버스를 타고 (약 26분 소요)웅남소방파출소 정류장에서 하차해서 유신맨션 옆 골목으로 들어가서 횡단보도를 건너 좌측으로 걸어가면 유신상가 (건너편) 정류장이 나오고 거기서 164번 버스를 타고(약 51분 소요.) 덕산해군아파트 정류장에서 하차하면 된다. 다만 창원시내버스 환승 시간이 30분 밖에 안되니 하차하는 즉시 재빠르게 유신상가 건너편 정류장으로 뛰어가기 바란다. 두번째 방법은 창원 종합터미널 앞 정류장에서 151번 버스를 타고 상공회의소 정류장에서 하차해서 (약 51분 소요.) 횡단보도를 건너 오른쪽으로 걸어가면 상공회의소(건너편) 버스정류장이 나오고 307번 버스를 타고 덕산해군아파트 정류장에서 하차하면 된다. (약 25분 소요.) 의료원 처음 가는 해군이라면 두번째 방법을 추천한다. 웬만하면 KTX 타고 창원중앙역이나 창원역에서 하차해서 752번,757번을 타고 가길 바란다.