충청북도 청주시 서원구 모충동에 위치하고 있는 학교법인 서원학원 산하의 사립 여자중학교이다.

1954년 7월 22일 재단법인 신라학원을 설립하고 1954년 9월 9일 신라여자고등공민학교로 개교하였다. 1955년 2월 25일 신라여중학교로 설립인가를 받고 1957년 2월 26일 제1회 졸업생 80명을 배출하였다. 1960년 4월 8일 모충동 286번지 신축교사로 이전하였으며 1960년 11월 19일 청주남여자중학교로, 1963년 1월 21일 충북여자중학교로 교명 변경인가를 받았다.

2019년 3월 4일, 대학 재단 산하 교육기관으로 충북여중을 비롯해 충북여고, 청주여상까지 학교법인 서원학원 소속 교사만 6명이 성폭력 가해자로 지목됐다. 교육청과 사립재단, 학교는 조사를 통해 해당 교사들을 곧바로 직위해제했다. 또 가해자로 지목된 교사와 학교는 눈물로 사과하고 재발 방지책을 만드는 등 문제 해결을 위해 신속하게 대응한 것으로 알려졌다. 연루된 교사 6명 중 5명은 검찰에 넘겨져 조사를 받고 있는 중이다. 학교법인 서원학원은 검찰 조사 결과를 바탕으로 재조사를 실시해 징계 여부를 결정한다는 입장이다. # 결국 청주지법 형사11부(나경선 부장판사)는 7일 아동·청소년의 성 보호에 관한 법률 위반(강제추행) 등의 혐의로 기소된 김 교사에게 징역 3년을 선고한 뒤 법정 구속했다. #