원생동물은 진핵생물역의 일종으로 원생생물의 일종으로 분류되거나 별도의 계로 분류되는 생물의 종류이다. 2010년에 토머스 캐빌리어 스미스가 유색조식물을 별도의 계로 분류함에 따라 개편됐다.#

전통적으로 네 가지 종류로 나뉘는데, 편모충류·육질충류·포자충류·섬모충류 등이 있다.