소닉 더 헤지혹 시리즈의 소닉 더 헤지혹 3와 소닉 & 너클즈를 도킹한 소닉 3 & 너클즈에서만 등장하는 거대한 카오스 에메랄드. 이 작품 이후로는 설정에서 없어져 해당 작품이 아닌 이상 등장하지 않는다.

보면 알겠지만 매우 크고 아름답다. 보통의 카오스 에메랄드와 달리 사용자가 직접 가지고 다니지도 않는다.

머시룸 힐 존의 첫 번째 스페셜 링은 무지개색으로 반짝이는데, 이를 건드리면 히든 팰리스에 있는 마스터 에메랄드의 제단으로 이동한다. 그리고 입장 전까지 모은 카오스 에메랄드가 거대화하여 마스터 에메랄드 주변에 있는 제단에 놓인다.[1] 소환된 에메랄드는 처음에는 빛이 꺼져있으며, 하나를 골라서 위에 올라서면 스페셜 스테이지를 플레이할 수 있다. 클리어할 경우 슈퍼 에메랄드를 획득했다는 문구가 나오고 플레이어가 올라탄 에메랄드의 빛이 돌아와 본래의 색을 되찾는다.[2] 이후 스페셜 스테이지를 클리어했든 하지 못했든 다시 히든 팰리스에서 나와 머시룸 힐로 돌아온다.

카오스 에메랄드를 다 모으지 않은 상태라면 이후 다시 일반적인 스페셜 링이 나오고, 7개를 모두 수집한 이후에는 위의 과정을 반복하여 슈퍼 에메랄드를 하나씩 수집할 수 있다.

소닉이나 너클즈의 경우 에메랄드를 모두 제단에 소환하고 나면 슈퍼 에메랄드 7개를 다 모을 때까지 슈퍼화가 불가능해진다. 따라서 슈퍼화를 지속하려면 스페셜 링을 피해야 한다. 예외적으로 더 둠스데이 존은 카오스 에메랄드만이라도 다 모은 채 데스 에그 존을 클리어하면 슈퍼 소닉 상태로 돌입할 수 있다. 그리고 테일즈는 어차피 슈퍼 에메랄드까지 전부 있어야 슈퍼화가 되므로 상관없다.

일단 슈퍼 에메랄드를 모두 모아야 소닉 3 & 너클즈의 진 엔딩을 볼 수 있으며, 소닉과 너클즈는 슈퍼화의 상위호환인 하이퍼 변신을 할 수 있게 된다. 각각의 명칭은 하이퍼 소닉과 하이퍼 너클즈. 카오스 에메랄드로 슈퍼화하지 못하는 테일즈 역시 슈퍼 에메랄드를 이용하면 슈퍼 테일즈로 변신할 수 있고, 하나뿐인 변신답게 매우 파격적인 능력을 지녔다. 하이퍼 소닉, 하이퍼 너클즈, 슈퍼 테일즈의 능력에 대해서는 하이퍼 소닉 문서 참조.

참고로 7개의 슈퍼 에메랄드를 모두 활성화하고 나면 그 시점부터 마스터 에메랄드도 주기적으로 빛을 뿜는다.

소닉 매니아를 너클즈로 플레이할 때, 라바 리프 존 액트 2에서 슈퍼 에메랄드와 유사하게 생긴 돌이 등장한다. 이 돌들은 설정상 소닉 매니아의 세계에서 카오스 에메랄드가 다시 흩어진 이후 만들어진 잔존 유물이다.# 다시 말해 진짜 에메랄드가 아니며, 이러한 특성 때문에 너클즈가 헤비 킹과 싸울 때 발판으로 쓰일 뿐 다른 역할은 하지 않는다. 그러나, 더미 데이터에서 슈퍼 에메랄드의 텍스쳐와 HYPER 문구를 보아 원래는 소닉 매니아에서 하이퍼 소닉과 슈퍼 에메랄드를 등장 시키려다 취소했다는 가설이 있다.

레고 디멘션즈에서 슈퍼 에메랄드가 소닉 3&K와 같은 모습으로 등장했는데 에그맨이 마스터 에메랄드를 훔쳐가다가 실수로 떨궈서 깨져버렸다! 레고인지라 소닉이 다시 조립해서 원상복구시켜버린다. 그 외에도 슈퍼 소닉이 무적 모니터를 파괴하면 하이퍼 소닉처럼 빛난다.