원래 뜻은 만화를 전문적으로 파는 서점이지만, 라이트노벨이 유행하고 서브컬쳐의 저변이 확대되면서 취급하는 물품이 많아졌다. 보통 만화, 라이트노벨, 그래픽노블, 일러스트북, 원서 등 책을 주로 취급하며, 곳에 따라서는 넨도로이드, 피그마같은 캐릭터 피규어나 열쇠고리, 카드텍 등 캐릭터 악세사리를 취급하기도 한다.[1]

90년대까지는 만화에 대한 부정적 국민정서 인식과 정부의 만화규제 등으로 그 수가 많이 없었으나 2000년대 이후로는 만화책만을 취급하는 서점들이 증가하였다. 단, 원래 없던 점포가 새로 생긴 것은 아니다. 90년대까지 만화방과 만화대본소를 상대로 도서를 공급하던 각 지역 총판들이 일반 독자 대상으로 소매 기능을 추가하면서, 만화 전문 서점의 형식을 갖춘 것이다.

개정 도서정가제 시행 이전에는 보통 평시 20% 할인, 이벤트시 30% 할인을 적용하는 곳이 많았으나 도서정가제 시행 이후에는 할인폭이 일반 인터넷서점과 같아져서 가격 경쟁력이 줄어들었다. 물론 이것은 다른 오프라인 서점에도 모두 해당하는 내용이며, 오프라인 대형서점에서는 아예 할인을 적용하지 않는다는 점을 보면 그나마 낫다고 볼 수 있다.

2018년 해외 불법 사이트 차단으로 마루마루가 폐쇄당한 이후 만화전문서점 업주 입장에서는 매출이 증가할 것으로 기대하고 있으며, 마루마루 홈페이지 폐쇄도 축하해주고 환영하고 있다. 만화전문서점에서 만화책을 많이 사줄수록 그만큼 한국 만화 시장이 성장하기 때문이다. 다만 마나모아 등의 불법 사이트는 여전히 만연하며 이를 근절하기엔 어려운 감이 없잖아 있다. 불법스캔에 대한 의식이 여전히 절실하게 필요하다. 게다가 2019년 일본 상품 불매운동으로 인한 탈덕 때문에 매출이 감소하는 것에 대한 우려도 표하고 있다 불법 스캔본이 판치는 만화 시장에 얼마나 영향을 끼칠까

2020년 대부분의 서점들이 장사가 잘 안 된다고 하며 폐업 위기설도 돌고 있다. 특히 도서정가제의 타격으로 매출이 상당히 줄어든 상황에서 코로나로 인해 심각한 타격을 입은 상황으로 보인다. 이게 다 도서정가제 발의한 최재천 때문이다

보통 문학(소설, 수필, 시), 인문, 자연, 정치/사회, 경제/경영, 여행/예술, 컴퓨터, 참고서 및 문제집이나 학습서, 어린이도서 등 다양한 분야의 서적들을 진열판매하는 일반서점과는 다르게 만화전문서점들은 말 그대로 만화책, 라이트노벨, 장르소설, 애니메이션 화보집 등의 특정 분야의 서적만을 판매한다는 것이 특징이다. 일반서점에서도 만화책이나 라이트노벨을 진열판매는 하지만 만화전문서점에 비하면 그리 많지는 않다.

현재는 이를 넘어 서브컬처를 표현하는 성지로 거듭나고 있는 편이다. 만화책, 라이트노벨을 넘어서 애니메이션 화보집, 캐릭터 피규어, 프라모델, 일본 만화 원서 등을 진열판매함으로서 그 역할이 넓어지고 있다.