매체 연재 경력이 없는 자라면 누구나 참여할 수 있다. 수상작 선정은 예선전은 독자들의 투표를 통해 상위 32작이 선정되며, 이후 부터는 토너먼트 방식으로 다시 독자 투표를 진행하여 우승작을 가린다.

한국 인터넷 환경 중 가장 이용률이 높은 포털 네이버에서 진행되는데다 최상위권 입상자들에게는 네이버 정식 연재권이 주어져 프로 데뷔를 꿈꾸는 웹툰 매니아들과 업계의 관심이 쏠리는 행사이다. 실제로 2013년 대회에서 8강 이상 진출한 작품들 전원이 정식 연재를 할 기회를 얻는 등 웹툰 작가를 꿈꾸는 사람들에게 등용문 역할을 하고 있다. 정식연재 될 수 있는 순위에 못들어도 이미 대회에서 인기를 끌었기에 도전만화 등 다른 경로를 통해서도 정식연재가 가능하다.

대회 시스템에 대한 비판이 많다. 특히 만화 작품을 토너먼트 형식으로 경합을 벌이는 것은 무리수라는 지적이다. 대최전은 토너먼트 회차가 넘어갈 때마다 새로운 에피소드를 선보여 경쟁하는 구조이다. 그러나 만화는 스토리 전개 상 흐름이 느려지거나 긴장감이 떨어지는 에피소드가 있기 마련이며 이것을 타 작품과 직접 비교 평가하는 것은 의미가 없다. 결국 참가한 작가들은 매 회 독자들의 관심을 끌기 위해 무리하게 자극적인 에피소드를 만들어내야 하고, 작화나 연출 외에 스토리 구성 능력을 평가하기가 어려워진다. 이에 네티즌들이 작가들이 단편만화를 투고하고 이를 평가하자는 제안도 나왔으나 네이버 웹툰은 지속적인 소비자 유지 및 유입을 위해 장편 웹툰을 선호하여 받아들여지지 않고 있다.

그러나 이를 감안하더라도 토너먼트 시스템을 도입한 것은 여전히 납득하기 힘든 부분이다. 애당초 토너먼트 방식은 순수한 실력뿐만 아니라 대전 운이 결과에 영향을 미치기 때문에 한 번에 모든 참가자를 평가할 수 없을 경우에 부득이하게 사용하는 경합 방식이다. 그저 작품을 나열해 놓기만 하면 모든 참가자를 평가할 수 있는 만화 공모전을 토너먼트로 치뤄야 할 필요성은 전혀 없다. 또한 대최전은 따로 3위 결정전을 열지 않고 4강에서 결승 진출자들 다음으로 득표수가 많은 작품이 3위로 선정되는데, 맞붙은 상대의 득표수에 따라 서로 경쟁적으로 득표가 늘어나는 경향이 있는 토너먼트에서 직접 경합을 벌여 보지도 않고 서로 다른 조에서 얻은 득표를 비교해 승자를 결정하는 것은 여러모로 불합리한 대회 운용이다. 결국 2020년 대회부터 토너먼트가 폐지되고 랭킹전이 도입되었다.

게다가 대진표 짜는 방식이 너무하다는 지적도 있는데, 32강에선 예선 순위 1위와 32위를 붙이고, 2위와 31위를, 3위와 30위를 붙이는 방식이다. 예선 상위 작품들이 서로 붙어서 32강에서 한번에 탈락하는걸 막으려는 의도로 볼 수도 있지만 1위와 32위를 붙이는건 공정성에 어긋난다고 보인다.

같은 계정으로 아이디를 세 개 까지 만들 수 있는 점을 악용해 중복투표가 이루어지는 등의 문제가 발생하기도 했다.

양질의 작품이 조기탈락하는 사태가 벌어지기도해 한때 네이버측이 아예 접수 및 선별 과정에서 괜찮은 작품만 투표목록에 올려놓으면 되지 않겠느냐는 제안도 나왔으나 파괘왕 사태 때 네이버의 해괴망측한 작품 철학 때문에 파괘왕 이후로는 묵사발된 의견이다. 자세한 것은 파괘왕 문서 참조.

여성향이 아니면 조기에 광탈 당하는 경우가 많아서 순위권은 여성향 뿐이라는 지적이 있다.#

#PC / #모바일 (@PC)

올해부터는 모든 것이 싹 뜯어 고쳐져서 시작된다.

중요한점 이라면 올해부터는 그동안 이어져 왔던 교수님들의 멘토 멘티 제도가 폐지 된다는 것이다. 게다가 한번이라도[1] 정식에 나온 사람은 아예 참가가 불가능하다. 이에 따라 이름도 바뀌었는데 2017 네이버 최강자전으로 바뀌었다.

참가 연령 제한이 풀린 탓인지 지원자 수가 어마어마한데, 접수번호로 참가자 수를 대략적으로 파악한 결과 마지막 접수일에 서버가 터지기 직전 접수번호가 1200번대였다고 한다. 후에 메일로 6시까지 연장접수를 받았으니 전년도 출품작 197개를 아득히 뛰어넘는 역대급 경쟁률의 공모전이 될것으로 보인다.

자세한 건 이쪽에서 보자. PC / 모바일

어마어마한 접수 인원 때문에 시간이 부족했는지, 결국 네이버 측에서 예선 진출작 공개 날짜를 8월 2~6일에서 8월 4~6일로 바꿨다. #

8월 6일 오후 5시에 예선작을 공개했다. 작품보는 곳(아카이브)

인원수가 많았는지 작품이 원래 100개 선발에서, 151개로 예선작품이 결정되었다. 현재 149개로 두 개가 줄었다.

다행히도 이번 최강자전은 역대 가장 많은 작품이 참여한것에 비해 예선전을 제외하면 표절 등 논란을 줄만한 사건은 일어나지 않았다.

다음은 2017 네이버 최강자전 출신 정식연재 작품들이다.

||<rowbgcolor=#D2D2D2,#000000> 작품 || 성적 || 연재일 || 연재처 ||

준결승(4강)~결승전에서 응원 덧글 이벤트가 열렸다. 추첨을 통해 1등은 블루투스 이어폰 (1명), 2등은 한국만화박물관 초대권 및 카페 이용권 (20명), 3등은 모나미 153 블랙&화이트 볼펜 or 네이버 웹툰 캐릭터 인형 (40명)을 준다고 한다.

7월 27일 예선전이 펼쳐진다. 그리고 이번 연도에는 모든 작품들을 장르별로 나누었다.링크

다음은 2018 네이버웹툰 최강자전 출신 정식연재 작품들이다.

||<rowbgcolor=#D2D2D2,#000000> 작품 || 성적 || 연재일 || 연재처 ||

7월 29일에 작품 105개가 공개되면서 예선전 투표가 시작됐다. #(@Wayback/@archive.is)

||<rowbgcolor=#D2D2D2,#000000> 작품 || 성적 || 연재일 || 연재처 ||

오랜 비판을 받아왔던 토너먼트 시스템이 랭킹전 시스템으로 변경된다고 한다. 지금까지 공지에 밝혀진 바에 따르면, 'n강'의 명칭이 'TOP n'으로 변경되었고, 예선전은 기존과 동일하다. TOP 32부터는 투표를 많이 얻은 팀이 상대팀을 이기고 다음 라운드로 진출하게 된다고 한다.

대회 시스템의 개편과 함께 일부 규정도 수정되었는데 대표적인 것만 요약하자면, 장려상(4~8위) 작품의 수상특전에 '네이버웹툰 연재작 피드백'이란 것이 추가되었는데, 정확히 밝혀진 것은 없지만 기존 대최전처럼 이들에게도 기회를 주려는 것으로 추정된다. 그리고 지금까지 금지되어왔던 외부 홍보 활동이 허용되었다! 또한, 이제 네이버웹툰 정식 연재가 확정된 상위 작품들(1~3위)은 반드시 1년 안에 연재를 시작해야 한다.

2017년 대회는 그 동안의 최강자전의 흐름을 바꾼 대회가 되었다. 그 동안 최강자전에서는 8강 미만의 작품들은 2016년 푸른사막 아아루를 제외하고 네이버 웹툰에서 연재조차 되지 않았으나 2017년 대회는 최초로 예선 탈락, 32강 탈락 작품 출신 네이버 웹툰 연재작 수가 8강 출신 네이버 웹툰 연재작 수를 뛰어넘는 대회가 되었다. 그리고 3위 출신 연재작들은 부진했으나 처음으로 자판귀가 상위권에 드는 인기를 얻으며 3위 부진 징크스를 깼다. 2018년에도 적극적으로 8강 이하의 작품들을 기용하고 있으며 3위인 겟백도 마찬가지로 상위권에 드는 인기를 얻고 있다. 오히려 2위[33]들이 사람들을 자극하는 주제라서 그런지 아직까지도 연재를 못하고 있다. 그런데 2020년 대회부터 정식 연재가 확정된 상위권 수상작(1~3위)이 수상작 발표 이후 1년 안에 연재해야 한다는 규정이 추가되었다. 이 규정이 추가된 이유는 아직까지 연재하지 못한 2위들 때문이 아닌가 추정된다.

모바일 웹툰 페이지에선 투표 기간일 경우 네최전 광고가 뜬다.

트래픽 문제인지 렉으로 댓글이 먹통이 되는 경우가 가끔 있다.